В период грузино-абхазского конфликта, по всей Грузии начались националистические митинги. 4 апреля 1989 г. в Тбилиси, под руководством лидеров грузинского национального движения во главе с З.Гамсахурдиа, И.Церетели, М.Костава и Г.Чантурия, на центральную площадь вышли протестующие с антисоветскими и антикоммунистическими лозунгами. 9 апреля 1989 года для разгона мирного митинга на улицы Тбилиси выехали танки и специальные отряды министерства внутренних дел. Тогда погибли 21 человек, большинство из которых были молодые женщины, всего пострадало около 4000 человек. В память об этих трагических событиях 9 апреля в Грузии отмечается День национального единства, гражданского согласия и памяти погибших за родину. Правительство Грузинской ССР было вынуждено подать в отставку, а Эдуард Шеварнадзе (министр иностранных дел СССР) прилетел из Москвы для урегулирования сложившейся ситуации.
В ноябре 1989 г., когда Советский Союз начал распадаться, Верховный Совет Грузии постановил, что грузинская власть главнее советской, и провозгласил Грузию захваченной страной, стремящейся к независимости.
Грузия была первой советской республикой, где выбрали не коммунистическое правительство. Звиад Гамсахурдиа (глава блока националистических партий) стал главой нового Верховного Совета. Он был харизматичным националистом и считал, что грузины долго были подавляемым национальным меньшинством в своей собственной стране, и хотел исправить эту несправедливость.
В марте 1991 г. Грузия бойкотировала референдум о будущем Советского Союза, в нем участвовали только жители Абхазии и Южной Осетии, а также служащие советских военных частей, которые поддерживали Союз. 31 марта грузинское правительство провело собственный референдум, где 93% населения проголосовали за независимость. 9 апреля 1991 г., в годовщину трагических событий, Верховный Совет провозгласил Грузию независимым государством, и в мае Звиад Гамсахурдиа был избран на пост президента.
Ситуация в стране оставалась тяжелой и нестабильной. Против Гамсахурдии пошел командир нацгвардии (армии) Тенгиз Китовани, Джаба Иоселиани, основатель военизированной (преступной) организации "Мхедриони" и Георгий Чантурия, лидер оппозиционной национал-демократической партии. Последних двух Гамсахурдиа посадил в тюрьму, начались демонстрации и протесты, которые переросли в вооруженные стычки. Гамсахурдиа оказался заперт в осажденном национальной гвардией и "Мхедриони" здании Парламента. Чантурия и Иоселиани были освобождены, как и 8000 обычных преступников, которые тут же получили в руки оружие. В уличных боях погибло около 200 человек, Гамсахурдиа был вынужден спешно покинуть Грузию.
Эдуард Шеварнадзе приехал в Грузию в марте 1992 г. и был назначен главой Государственного Совета, который был создан вместо Верховного совета. Иоселиани стал заместителем председателя, а Китовани — министром обороны. Фактически главой государства стал Шеварнадзе — председатель парламента. Шеварнадзе пытался взять под контроль силы национальной гвардии и "Мхедриони", которые тогда управляли все страной. Это были фактически бандитские группировки, которые контролировали всю торговлю в стане, грабили жителей, насиловали женщин, ставили на дорогах контрольно-пропускные пункты и обирали автомобилистов, забирали автомобили. В 1992 — 1993 гг. министром внутренних дел был Теймураз Хачишвили — бывший преступник, который получил пост благодаря влиянию "Мхедриони".
Многие годы в Грузии царил полный хаос — преступные группировки, отсутствие электричества и воды, высокие цены, отсутствие работы и низкие пенсии. Это сейчас мои собеседники вспоминают те времена с ноткой юмора — как автомобили поднимали подъемным краном на собственные балконы многоэтажек, чтобы "мхедрионовцы" не отобрали; или как в горных регионах малые дети не знали, что такое электричество, жили при свечах и потом пугались, когда появлялось электричество и загоралась в комнате лампочка; или как в прикроватной тумбочке, рядом с библией, лежало оружие, чтобы в случае проникновения бандитов в дом - защитить семью. Это были тяжелые времена для Грузии.
На Шеварнадзе было совершено несколько покушений, в которых обвинили, в том числе и Иоселиани. Однако, Шеварнадзе вел довольно хитрую политику — он стравливал всех бандитов между собой до тех пор, пока они все не оказались в тюрьме или не поубивали друг друга.
В сентябре 1995 г. в стране была введена новая денежная единица — лари, в ноябре прошли выборы в Парламент по новой Конституции (фактически написанной Шеварнадзе), где партия "Союз граждан Грузии" во главе с Шеварнадзе получила почти половину всех мест. На президентских выборах Шеварнадзе получил 75% голосов избирателей. Председателем и спикером Парламента был избран современно мыслящий Зураб Жвания. Наконец-то начались реальные реформы — заработала программа стабилизации Международного валютного фонда, был заключен договор о сотрудничестве с Европейским Союзом и налажены связи с соседними странами.
В январе 1999 г. Грузию приняли в Совет Европы, а в июне 2000 г. - во Всемирную торговую организацию (таким образом Грузия обошла большинство постсоветских стран).
В апреле 2000 г на президентских выборах Эдуард Шеварнадзе набрал 80% голосов избирателей.